बीज प्रमाणीकरण का कार्य बीज अधिनियम 1966 की धारा 8 के अंतर्गत गठित बीज प्रमाणीकरण संस्था द्वारा किया जाता है। मध्यप्रदेश राज्य में इस कार्य हेतु मध्यप्रदेश राज्य बीज प्रमाणीकरण संस्था की स्थापना 21 जनवरी 1980 को की गई।
बीज प्रमाणीकरण का उद्देश्य अधिसूचित किस्मों के उच्च कोटि के बीज एवं प्रवर्धन सामग्री, जिनका उत्पादन एवं वितरण इस तरह से किया गया हो कि उनकी अनुवांशिक पहचान, अनुवांशिक शुध्दता, भौतिकशुध्दता, स्वास्थ्य स्तर तथा अन्य गुण, प्रमाणीकरण द्वारा बनाये रखकर, कृषकों को उपलब्ध कराना है।